Elemi iskoláit Pápán végezte. 1940-48 között a pápai bencés gimnázium diákja volt. Érettségi után a Pécsi Orvostudományi Egyetemre nyert felvételt, ahol 1954-ben szerzett orvosdoktori diplomát.
A Pécsi Orvostudományi Egyetem (POTE) Élettani Intézetében kezdte pályáját (1950-1955). 1955-től a Fül-Orr-Gége Klinikán dolgozott: tanársegéd, adjunktus, docens, egyetemi tanár, a klinika tanszékvezetője, majd igazgatóhelyettese, 1974 és 1994 között igazgatója volt.
1985-től az orvostudomány kandidátusa, 1989-től MTA nagydoktora (DSc), 1999. óta a klinika emeritus professzora.
1985-91. és 1995-97. között az Pécsi Orvostudományi Egyetem rektora, 1982-1994-ig a Magyar Fül-orr-gégeorvosok Egyesülete Audiológiai Szekciójának elnöke, majd 1994 és 1996 között a Magyar Fül-orr-gégeorvosok Egyesületének Elnöke volt.
Tagja a Collegium Oto-Rhino-Laryngological Amicitiae Sacrumnak. Egy periódusban tagja volt az IFOS (International Federation of Otolaryngological Societies) Executive Commitee-nek. Szerkesztőbizottsági tagja volt a Clinical Otolarynology és az Oto-rhino-laryngologica Nova című lapoknak, tiszteletbeli szerkesztőbizottsági tagja a Fül-orr-gégegyógyászat című lapnak. Tiszteletbeli Tagja volt a Német Demokratikus Köztársaság, a Német Szövetségi Köztársaság, a Lengyel-, Szlovák-, Osztrák Fül-orr-gégészeti Egyesületeknek, tagja volt a Cseh Purkyné Orvosi Társaságnak.
Kutatási területe: Hallásélettan, a hallórendszer elektrofiziológiája. A középfül helyreállító sebészete. Magyarországon ő vezette be a Pearson-féle gégeműtétet. Napjainkban a szétvált hallócsontok összeragasztásának lehetséges módszereivel foglalkozik.
Munkái: — Halló- és látókérgi kiváltott potenciálok változásai időleges kapcsolat kiépülésekor. Grastyán Endrével. Budapest, Akadémia Kiadó, 1961.; — Hallócsont-lánc reconstructio csont autotransplantatummal: Kandidátusi értekezés; MTA TMB, 1967. Pécs, 1967. 1-2. köt.; — A cochlea és centralis kapcsolatai: a Magyar Fül- Orr- Gégeorvosok Egyesületének 1977. évi kongresszusa: Pécs, 1977. július 3–6.: referátum/Bauer Miklós, Rejtő Kálmán. [Pécs]: Pécsi Szikra Ny., 1977. 210, [28] p.; — Fül-orr-gégészeti propedeutica. Pécs : POTE, 1979. 133 p. ill.; — Nem integrált klinikai orvostan bázis-anyagai: Fül-orr-gégészeti propedeutica. Pécs : Orvostudományi Egyetem, 1982. 122 p.; — Magyar Fül-Orr-Gégeorvosok Egyesülete 32. Kongresszusa: Budapest, 1987. aug. 26-28. Debrecen: DOTE, 1987.; — Tympanoplastica: a PTE ÁOK Fül-Orr-Gégeklinikájának "Fülészeti Microchirurgiai Cursusok" előadásai. Budapest; Medicina, 2003. 178 p. ill. ISBN 963-242-841-2.
Jegyzetek: Pécs Lexikon I. (A–M). Főszerkesztő Romváry Ferenc, Pécs Lexikon Kulturális Nonprofit Kft. 2010, Pécs. 92. o. ISBN 978-963-06-7919-0; Ma Pécsi Tudományegyetem Általános Orvosi Kar (PTE ÁOK); Közlöny. a Magyar Tudományos Akadémia Biológiai és Orvosi Tudományok Osztályának Közleményeiből, 141-147. p.; 2. köt.: Ábrák.; A kötet szerzői Bauer Miklós fül-orr-gégész mellett az ő szaktársai: Ribári Ottó (1932-), Szabó László, Szabó Iván.; Magyar és angol nyelven, a cím angolul: Tympanoplasty: lecture on the otologic microsurgical courses.
Díjak, elismerések: 1980 – a Munka Érdemrend arany fokozata, 1987 – Magyar Fül-Orr-Gégészeti Cseresnyés-emlékérem, 1987 – Haza Szolgálatáért emlékérem, 1988 – A Magyar Népköztársaság Csillagrendje kitüntetés, 1992 – Pro Universitate aranyérem, 1998 – A Magyar Köztársasági Érdemrend Tisztikeresztje, 1999 – Pécs Város Díszpolgára, 2005 – Batthyány-Strattmann László díj, 2009 – a Kassai Pavel Josef Safaryk Egyetem honoris causa díszdoktora.
Forrás,Irodalom:https://hu.wikipedia.org/wiki/Bauer_Mikl%C3%B3s_%28orvos%29, https://www.mkb.hu/dl/media/group_463afc792a1fd/group_4f06b8aa7ae65/item_4166.pdf, http://www.jelenkor.net/archivum/cikk/685/latni-kell-a-fulet, http://aok.pte.hu/docs/hirmondo/pdf/okh_1001.pdf, Pécsi Tudományegyetem ÁOK; Bauer Miklós (fül-orr-gégész orvos) az MTA honlapja.. Berecz Endre: A pápai volt bencés gimnázium neves tanítványai 1806-1948 c. kiadványa
